陆续有研究发现,咖啡可以降低得到阿兹海默症、老年失智症、帕金森氏症的风险,还可减少胆结石的形成或痛风的发生,甚至预防龋齿。

2012年5月中《新英格兰医学期刊》报导,一天喝2到3杯咖啡的人(无论有无咖啡因),长寿的机率较高,其中男性喝咖啡者比不喝者长寿机率高出10%,女性则为13%。不过,这篇是流行病学统计分析,收集40万人的资料观察到此一现象,但不能反推说一天喝2至3杯咖啡就会比较长命,也没有分析所喝咖啡的种类是拿铁还是黑咖啡、有无加糖、加奶精等。

但有高血压、胃溃疡或逆流性食道炎、心脏病、缺铁性贫血或长期失眠的人都不适合喝咖啡。此外,对孕妇来说,若饮用过量咖啡(超过5杯),有可能增加流产风险。

另外一些观察性研究显示,摄入含咖啡因的饮料与骨密度降低、骨折风险增加有关,因此老年人和停经后女性必须避免大量摄入咖啡因。不过,咖啡因虽然对肠道钙离子的吸收具有微弱的抑制效应,但不会增加尿液中钙离子的排泄;因此在咖啡中加牛奶,多少可以改善这个问题。